O Comité Director é um órgão ad-hoc presidido pelo Comissário responsável pela Agricultura, Ambiente e Recursos Hídricos da CEDEAO. É composto pelo Comissário responsável pela Agricultura, Ambiente e Recursos Hídricos, pelo Director da Agência, pelo Director do Fundo e por um representante das organizações de produtores agrícolas. O Comité reúne-se duas vezes por ano para validar o plano anual de trabalho, os projetos e programas realizados pelos atores regionais. A última sessão do ano é principalmente dedicada à análise dos relatórios de avaliação interna ou externa encomendados pela Agência.